自2009年《珠三角一体化规划纲要》实施以来，珠三角地区跨市公交开通一度如火如荼。记者统计发现，除已实施多年的广佛跨市公交外，两年来深莞惠、珠中江六城间共开通21条跨市公交线路。风光两年之后，六城之间大多数跨市公交却不约而同面临亏损困境。由此带来的连锁反应是，跨市公交新线路面临难产。多地交通部门坦言，两地利益拉锯，是跨市公交目前面临的最大问题。
线路缺陷导致亏损
线路设置存在缺陷，是珠三角多条跨市公交暴露的共同问题。开通于2009年底的珠海体育中心南至中山三乡的999路跨市公交，由于珠海站点设置偏离市中心拱北，致使该线路自开通以来，一直客源稀少，经营亏损严重。
中山与江门开通的351路(中山古镇至江门荷塘)跨市公交也面临同样的困境。南都记者走访获悉，由于该线路仅仅连接中山与江门的两个相邻城镇，不能直达任何一方的城区范围，致使客流一直零落，经营惨淡。
在亏损方面，东莞石排至惠州博罗圆洲的跨市公交线路甚是严重。该线路开通近两年，仅东莞运营方就亏损160多万元。3月17日接受南都记者采访时，东莞石排镇公汽公司经理陈俊明表示，该线路全程仅8公里，线路较短且设置之初未优化线路，存在同线竞争，亏损严重。
利益拉锯加剧亏损
一方面是多条跨市公交高呼亏损，另一方面，则是跨市地界的市民出行需求难以得到满足。其实，跨市公交的难产，其背后深层次的原因，是两地的利益拉锯。
在珠海及中山采访时记者发现，尽管有3万多户居民经常往来于中山坦洲与珠海之间，但官方对于开通两地跨市公交一事，一直不予支持。对此，中山市交通局有关部门负责人表示，开通跨市公交牵涉部门众多，利益复杂，目前仍未确定。珠海市交通局一名负责人也坦言，公交线路跨市营运，势必导致当地运营企业客源减少，正是存在利益拉锯，中山坦洲至珠海的跨市公交也一直难产。
莞惠跨市公交也存在相同问题。一位不愿透露姓名的业内人士对记者表示，当初东莞石排至惠州博罗圆洲的跨市公交在开通时，惠州方面就对既有利益作了妥协，保留了由博罗黄巴公司经营的跨市营运线路(非公交线路)，导致莞惠公交面临同线竞争，加剧了亏损。
记者了解到，多数线路亏损严重，也伤害了珠三角部分地市继续开通跨市公交的意愿。如江门原计划开通6条跨市公交线路，在开通首批2条线路后，便搁置了后续计划。
政府应该长期支持
谈及跨市公交面临的种种困境，有业内人士表示，珠三角各地交管部门，有必要应时而动，针对实际情况，联手优化改革跨市公交，“交管部门不应该把这当成一种政治任务，觉得搞完就算了，实际上，改革才刚刚开始。要不然企业经营不下去，问题肯定会出现。”
国家交通部科学研究院交通技术咨询中心副主任景春光博士建议，珠三角各地政府首先应明确界定区别“跨市公交”和“道路客运”两种方式，跨市公交本质上系为民众提供普遍的公共交通服务，而非简单的市场经营存在。在此基础上，政府对于跨市公交的经营，应从考虑老百姓出行的便利性，及未来如何衔接珠三角轨道交通网等方面予以规划支持。
景春光认为，珠三角各地政府还应考虑将跨市公交纳入公共财政预算，主动出资支持其发展，“不能说开通了就没事了，政府应该有一个长期的支持行为，将其作为珠三角交通一体化的实施措施之一，予以长期可持续的经营和支持。”
他们不同
部分线路客源火爆
当然，跨市公交并非全线亏损，一些线路就呈现出良好的经营态势，客源火爆。开通于2009年12月的深莞首条跨市公交就是如此。由于边界人员往来频密且票价低廉，往来于深圳观澜与东莞塘厦间的该条线路客来客往“深莞1线，我们从塘厦坐过来全程才3块钱，而且线路都很直，路程也比价短。”有乘客这样评价。基于此，东莞随后再次开通了从东莞凤岗开往深圳观澜的深莞2线，去年9月，深圳的5条公交线又被批准在东莞凤岗的4个站点上下客。
此外，部分并非按照政策要求开通的跨市公交，其经营状况也值得称道。早在2009年2月份，中山就和顺德开通了首条真正意义上的跨市公交80路。这是中山目前运营最好的跨市公交。开通的第一个月，该线路的运营就实现了保本，之后的每个月该条线路都能够实现盈利。
深惠首条跨市公交168路的经营情况也一直较佳。记者从惠州市交通运输局获悉，有鉴于部分跨市区域的出行需求及既有线路的良性发展，惠州方面计划再增加3条与深莞的跨市公交线路，目前正在进行前期调研。
跨市公交之最
最旺线路：广佛公交
上榜理由：广佛公交共有70条线路，其中广佛公交线路30条、广佛快巴20条、广佛城巴线路约20条。这恐怕跟广佛之间来往密切的程度有莫大关系。每天，数以万计的广佛候鸟奔波在两地，除了广佛地铁，广佛公交仍是不少人赖以出行的交通工具。
最长线路：莞深公交
上榜理由：相对于珠三角一般10公里以内的跨市公交来说，莞深1线足有2倍之长，共21公里，从东莞塘厦开往深圳观澜，全程行驶时间约1个小时，途经23个站，全程3元。
最贵线路：珠中公交
上榜理由：由于只在两市边界跑，跨市公交一般定价为2-3元，并且分段收费，而中山珠海的跨市公交999路实行的是5元一票制，对于很多可能只是坐一两个站点跨市的市民来说，性价比实在低。这也是该公交冷清少客的主要原因。
最冷线路：珠中公交、莞惠公交
上榜理由：因5元一票制和线路设置不合理，珠中公交999路经常来回只拉回一个乘客。而东莞惠州开通的首条跨市公交东莞石排———惠州博罗园洲，也因客源稀少而造成亏损严重，日均客流仅100人次。
